AlphaFold 3 向解码分子行为和生物计算迈出重要一步,Nature 子刊锐评(alpha for)

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原标题:AlphaFold 3 向解码分子行为和生物

计算迈出重要一步,Nature 子刊锐评

关键字:复合物,蛋白质,结构

,分子,生物

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如果我们完全了解分子之间是如何相互作用的,那么生物学就没什么可学的了,因为每一种生物现象,包括我们如何感知世界,最终都源于细胞内生物分子的行为和相互作用。

最近推出的AlphaFold 3 可以直接从蛋白质、核酸及其配体的序列中预测生物分子复合物的 3D 结构。这标志着我们在长期探索生物分子如何相互作用方面取得了重大进展。

AlphaFold 3代表了直接从复合物序列预测其三维结构的突破,为生物分子相互作用提供了见解。

生物分子(如蛋白质或核酸)的一维 (1D) 序列以类似于一段代码指定程序的方式指定细胞功能。该序列表示编程语言中的代码,并通过折叠过程「编译」成机器语言中的代码,形成独特的 3D 结构。该程序由折叠的生物分子与细胞内其他分子之间的相互作用执行。

由于其独特的三维结构,生物分子只会与细胞内的一小部分分子(例如 DNA 位点)相互作用,这些相互作用将引发一系列精心策划的化学和结构转化,共同定义生化程序(如转录)。生化过程的产物(如 RNA)代表执行程序的输出。

因此,在生物学中,生物分子的一维序列编码了程序以及编译和执行程序的方法;该序

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