仅几秒,准确推断蛋白动力学信息,山大、北理工等AI模型RMSF-net登Nature子刊(动力蛋白名词解释细胞生物学)

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原标题:仅几秒,准确推断蛋白动力学

信息,山大、北理工等AI模型RMSF-net登Nature子刊

关键字:动力学,蛋白质,电子显微镜,解读,报告

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蛋白质的动力学对于理解其机制至关重要。然而,通过计算预测蛋白质动学信息具有挑战性。

在此,来自山东大学、百图生科(BioMap)、北京理工大学、湖北医药学院、宁夏医科大学和阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)的研究团队,提出了一个神经网络模型 RMSF-net,其优于以前的方法,并在大规模蛋白质动力学数据集中产生最佳结果;该模型可以在几秒钟内准确推断出蛋白质的动力学信息。

通过从实验蛋白质结构数据和低温电子显微镜 (cryo-EM) 数据集成中有效地学习,该方法能够准确识别低温电子显微镜图和 PDB 模型之间的交互式双向约束和监督,以最大限度地提高动力学预测效率。

RMSF-net 是一个可免费使用的工具,将在蛋白质动力学研究中发挥重要作用。

该研究以「Accurate Prediction of Protein Structural Flexibility by Deep Learning Integrating Intricate Atomic Structures and Cryo-EM Density Information」为题,于 7 月

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